Nội dung phim Thành Phố Tương Lai - Ergo Proxy Con người đã làm ô nhiễm biến Trái Đất thành hành tinh chết. Những kẻ sống sót tập trung với nhau lại xây dựng nên một thành phố cách ly hoàn toàn với thế giới bên ngoài, Romdeau. Ở Romdeau, con người chung sống với các Autoreiv, những cyborg được chế tạo để phục vụ con người. Vấn đề phát sinh khi các Autoreiv này nhiễm một loại virus bí ẩn, Cogito, và con người không thể kiểm soát cũng như ra lệnh cho chúng được nữa. Những Autoreiv bị nhiễm Cogito tìm mọi cách để trốn ra bên ngoài Romdeau, và chúng giết bất cứ ai ngăn cản chúng, gây ra nhiều vụ án mạng ở Romdeau. Vụ việc trở nên ngày một nghiêm trọng, chính quyền thành phố cử Riru Mayer thuộc Cục Tình Báo cùng với Iggy, Autoreiv tùy tùng của cô đi điều tra chuyện này. Trong quá trình điều tra, Riru đã khám phá ra những bí mật khủng khiếp mà những kẻ đứng đầu Romdeau đang che dấu...
,