Mật Lệnh Cuối Cùng (The Silent War) lấy bối cảnh Thượng Hải năm 1949, thời điểm nội chiến Trung Quốc đang diễn ra gay gắt. Phe Quốc Dân Đảng tìm mọi cách chống phá lực lượng cách mạng. Để đối phó, tổ chức 701 – một tổ chức tình báo của Đảng Cộng Sản Trung Quốc đã tiến hành giám sát các kênh vô tuyến nhằm nghe lén những thông tin quân sự của địch. Tuy nhiên, một ngày nọ, tất các kênh vô tuyến này đều đột ngột thay đổi tần số một cách bí ẩn. Trước tình hình đó, Lão Quỷ (Vương Học Binh) – người đứng đầu 701 đã phái Trương Học Ninh (Châu Tấn) - nữ tình báo xinh đẹp mang mã số 200 đi Thượng Hải để tìm người có thể nghe được những sóng âm có tần số thấp. Và tại đây, Học Ninh đã phát hiện ra A Binh (Lương Triều Vỹ) – một thợ sửa đàn piano bị mù nhưng có độ cảm âm vô cùng xuất sắc.